Kort om
Professor Niclas Karlssons forskning fokuserer på rollen til glykosylering i menneskers helse. Glykaner er allestedsnærværende i biologiske grensesnitt, inkludert glykokalyx på cellemembraner, på slimhinneoverflater som beskytter mage-tarm-, lunge- og reproduktive kanaler og leddene i muskelskjelettsystemet. Gruppen bruker state-of-the-art massespektrometrisk og HPLC-basert glykomikk og glykoproteomikk av både N-linked og O-linked glykoproteiner for å identifisere patologisk endring av glykosyleringen.
Databaser:
UniCarb-DB (https://unicarb-db.expasy.org)
UniCarb-DR (https://unicarb-dr.glycosmos.org).
Publikationer:
Pubmed (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/myncbi/1-Wzd4_y7_JkD/bibliography/public/)
Twitter: UniCarb-DB@NG_Karlsson
Forskningsgrupper
Forskningsprosjekter
Aktive forskningsprosjekter
-
Glykopatologi ved tørre auge
Ph.d.-prosjektet utforskar korleis mucinprotein og deira glykosylering held oppe ein stabil og sunn tårefilm, samtidig undersøker vi betydninga deira i utviklinga og progresjonen av tørre auge-sjukdom.
-
Inhibitor-mediert programmering av glykoformer (IMProGlyco)
Prosjektet utviklar metodar for å endre den naturleg forekommande karbohydratoverflata som finst på alle celleoverflatene hos menneske.
Avsluttede forskningsprosjekter
-
Integrerte glykomikkprodukter for presisjonsmedisin mot kreft (GlycoMap)
Prosjektet undersøkjer organoider og nye glykomiske metodar for presisjonsmedisin mot kreft.
Publikasjoner og forskningsresultater
Vitenskapelige publikasjoner
Afshari, Ali Reza
; Chang, Vincent; Thomsson, Kristina A.; Höglund, Jennifer; Browne, Elizabeth N.; Karadzhov, George; Mahoney, Keira E.; Lucas, Taryn M.; Rangel-Angarita, Valentina; Ryberg, Henrik; Gidwani, Kamlesh; Pettersson, Kim; Rolfson, Ola; Björkman, Lena I.; Eisler, Thomas; Schmidt, Tannin A.; Jay, Gregory D.; Malaker, Stacy A.;
Karlsson, Niclas
(2025).
Glycoproteoforms of Osteoarthritis-associated Lubricin in Plasma and Synovial Fluid.
Molecular & Cellular Proteomics.
Vol. 24.
https://doi.org/10.1016/j.mcpro.2025.100923
Rustad, Cecilie F.; Backe, Paul Hoff; Jin, Chunsheng; Merckoll, Else; Tveten, Kristian;
Maciej-Hulme, Marissa Lucy
;
Karlsson, Niclas
; Prescott, Trine; Sandås, Elise Mørk; Woldseth, Berit; Elgstøen, Katja B. Prestø; Holla, Øystein Lunde
(2024).
A monoallelic UXS1 variant associated with short-limbed short stature.
Molecular Genetics & Genomic Medicine.
Vol. 12.
https://doi.org/10.1002/mgg3.2472
Acharya, Binayak;
Tofthagen, Marthe
;
Maciej-Hulme, Marissa Lucy
; Suissa, Michal Rachel;
Karlsson, Niclas
(2024).
Limited support for a direct connection between prebiotics and intestinal permeability – a systematic review.
Glycoconjugate Journal.
https://doi.org/10.1007/s10719-024-10165-8
Bechtella, Leïla; Chunsheng, Jin; Fentker, Kerstin; Ertürk, Güney R.; Safferthal, Marc; Polewski, Łukasz; Götze, Michael; Graeber, Simon Y.; Vos, Gaël M.; Struwe, Weston B.; Mall, Marcus A.; Mertins, Philipp;
Karlsson, Niclas
; Pagel, Kevin
(2024).
Ion mobility-tandem mass spectrometry of mucin-type O-glycans.
Nature Communications.
Vol. 15.
https://doi.org/10.1038/s41467-024-46825-4
Urban, James; Jin, Chunsheng; Thomsson, Kristina A.;
Karlsson, Niclas
; Ives, Callum M.; Fadda, Elisa; Bojar, Daniel
(2024).
Predicting glycan structure from tandem mass spectrometry via deep learning.
Nature Methods.
Vol. 21.
https://doi.org/10.1038/s41592-024-02314-6
Saldova, Radka; Thomsson, Kristina A.; Wilkinson, Hayden; Chatterjee, Maitrayee; Singh, Ashish K.;
Karlsson, Niclas
; Knaus, Ulla G.
(2024).
Characterization of intestinal O-glycome in reactive oxygen species deficiency.
PLOS ONE.
Vol. 19.
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0297292
Swisa, Avital; Kieckhaefer, Julia; Daniel, Scott G.; El-Mekkoussi, Hilana; Kolev, Hannah M.; Tigue, Mark; Jin, Chunsheng; Assenmacher, Charles-Antoine; Dohnalová, Lenka; Thaiss, Christoph A.;
Karlsson, Niclas
; Bittinger, Kyle; Kaestner, Klaus H.
(2024).
The evolutionarily ancient FOXA transcription factors shape the murine gut microbiome via control of epithelial glycosylation.
Developmental Cell.
https://doi.org/10.1016/j.devcel.2024.05.006
Takahashi, Yushi;
Karlsson, Niclas
; Okuda, Shujiro; Aoki-Kinoshita, Kiyoko F.
(2024).
Cooperation of GlycoPOST and UniCarb-DR towards a comprehensive glycomics data repository workflow.
Analytical and Bioanalytical Chemistry.
https://doi.org/10.1007/s00216-024-05673-3
Kamounah, Sarah; Thomsson, Kristina A.; Sørensen, Christiane Elisabeth; Bennett, Eric Paul;
Karlsson, Niclas
; Pedersen, Anne Marie Lynge
(2024).
Altered O-Glycans in stimulated whole saliva from patients with primary Sjögren’s syndrome and non-pSS sicca.
Scientific Reports.
Vol. 14.
https://doi.org/10.1038/s41598-024-79473-1
Jin, Chunsheng; Venkatakrishnan, Vignesh; Thomsson, Kristina A.; Aoki, Nobuyuki P.; Shinmachi, Daisuke; Aoki-Kinoshita, Kiyoko F.; Hayes, Catherine A.; Lisacek, Frédérique;
Karlsson, Niclas
(2024).
UniCarb-DB: An MS/MS Experimental Glycomic Fragmentation Database.
Methods in molecular biology.
Vol. 2836.
https://doi.org/10.1007/978-1-0716-4007-4_6
